Район Голубой бухты г. Геленджика всегда был богат археологическими памятниками. Еще до революции на территории бухты, тогда носившей название «Рыбацкая» проходили раскопки могильника «Борисовский» под руководством В.В. Саханева, давшие ученым интересный материал о периоде раннего средневековья. На территории Голубой бухты было выявлено несколько археологических памятников. Фонды музея хранят предметы, найденные на этой территории и относящиеся к разным историческим эпохам от бронзового века до средневековья.
Часть находок поступала в музей не от археологов, а от местных жителей, находивших их в ходе проведения строительных работ.